RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 COL8A1P27658 744 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-211ENST00000484135 TYRO3Q06418 890 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 RTN1Q16799 776 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SYT9Q86SS6 491 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCA4P51532 1647 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 KLF15Q9UIH9 416 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 FOXO3O43524 673 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SPEM2Q0P670 501 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 NEUROD1Q13562 356 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 CHSY3Q70JA7 882 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD6Q96KE9 485 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ARID3CA6NKF2 412 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 GNB5O14775 395 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SLC30A3Q99726 388 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 WEE1P30291 646 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 WIZO95785 1651 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ALAS2P22557 587 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 STK32AQ8WU08 396 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 KLK14Q9P0G3 267 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-211ENST00000484135 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 PRMT3O60678 531 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 SIN3BO75182 1162 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 DGKGP49619 791 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ4P56696 695 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 DGKZQ13574 1117 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 IER5Q5VY09 327 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 CD163Q86VB7 1156 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ELOA3Q8NG57 546 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 BHMTQ93088 406 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 EPB42P16452 691 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ATG7O95352 703 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA5Q96PV4 448 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 BCS1LQ9Y276 419 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 IDH3AP50213 366 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF25Q93038 417 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ADH7P40394 386 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNA4P43681 627 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 DOC2BQ14184 412 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf37Q86TY3 774 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 MYO19Q96H55 970 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 IGFLR1Q9H665 355 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 ARSDP51689 593 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-211ENST00000484135 CCINQ13939 588 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 SMARCA2P51531 1590 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 M0R082 166 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 MICAL2O94851 1124 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 NFKB1P19838 968 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 GATA4P43694 442 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-211ENST00000484135 OCLNQ16625 522 aa8.2□□□□□ -1.1
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