RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483150.1

RREB1-208, Transcript of ras responsive element binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RREB1, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1-208ENST00000483150 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 PLCB2Q00722 1185 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 AACSQ86V21 672 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 PSMA5P28066 241 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 TEFQ10587 303 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 KSR2Q6VAB6 950 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.98□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 SLC27A2O14975 620 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 PDCP20941 246 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 FAM227BQ96M60 508 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 MAP3K11Q16584 847 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 KIF3AQ9Y496 699 aa14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.96□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.96□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.96□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.96□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 NCAPD2Q15021 1401 aa14.96□□□□□ -0.01
RREB1-208ENST00000483150 UTYO14607 1347 aa14.96□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SASH1O94885 1247 aa14.96□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 KCNJ4P48050 445 aa14.96□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 ANKRD1Q15327 319 aa14.96□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.96□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 LIG1P18858 919 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TSC1Q92574 1164 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 JCADQ9P266 1359 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 MED23Q9ULK4 1368 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 KCNA6P17658 529 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TYRO3Q06418 890 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PROSER3Q2NL68 480 aa14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 RNF20Q5VTR2 975 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 C14orf37Q86TY3 774 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 KAZALD1Q96I82 304 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 RPS6KB1P23443 525 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 FERMT3Q86UX7 667 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SPC24Q8NBT2 197 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 ARID3AQ99856 593 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.94□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 A0A0D9SFI3 127 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 GRM8O00222 908 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 LINS1Q8NG48 757 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SUCLG2Q96I99 432 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 MRC1P22897 1456 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PXDNQ92626 1479 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.93□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CAMK4Q16566 473 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TNMDQ9H2S6 317 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 LUZP1Q86V48 1076 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 FSD1Q9BTV5 496 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 DACT1Q9NYF0 836 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.92□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 SPATA32Q96LK8 384 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 PTGS1P23219 599 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 CBX8Q9HC52 389 aa14.91□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.9□□□□□ -0.02
RREB1-208ENST00000483150 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms