RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 ANP32CO43423 234 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 TCIRG1Q13488 830 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
UPP1-211ENST00000482015 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 NLRP10Q86W26 655 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 ZNF428Q96B54 188 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 MRS2Q9HD23 443 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 SYNE4Q8N205 404 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 NLRP3Q96P20 1036 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 HYPKQ9NX55 129 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 POTECB2RU33 542 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 SLC51AQ86UW1 340 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 CEP350Q5VT06 3117 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 FSTL1Q12841 308 aa24.33■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UPP1-211ENST00000482015 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.33■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 WWC1Q8IX03 1113 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.32■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 APLP1P51693 650 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 CCDC27Q2M243 656 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 TSPYL6Q8N831 410 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 SNED1Q8TER0 1413 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 PSMD1Q99460 953 aa24.3■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 ABCC4O15439 1325 aa24.29■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 WDR90Q96KV7 1748 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 FAM89AQ96GI7 184 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.28■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA2Q08379 1002 aa24.27■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UPP1-211ENST00000482015 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.26■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 HTRA3P83110 453 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.25■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 FZD9O00144 591 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 JDP2Q8WYK2 163 aa24.24■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 BBOX1O75936 387 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 MYD88Q99836 296 aa24.23■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 IL16Q14005 1332 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 POTEIP0CG38 1075 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 POTEJP0CG39 1038 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 GRAPQ13588 217 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.22■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 COL4A5P29400 1685 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 SP8Q8IXZ3 490 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.21■■□□□ 1.47
UPP1-211ENST00000482015 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 LAMB2P55268 1798 aa24.2■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 PPIP5K2O43314 1243 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 AOC3Q16853 763 aa24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
UPP1-211ENST00000482015 STK31Q9BXU1 1019 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms