RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 GCKRQ14397 625 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 ABCC12Q96J65 1359 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-210ENST00000477812 FAM177BA6PVY3 158 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 CNBD1Q8NA66 436 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 NYXQ9GZU5 481 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 CASP7P55210 303 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 SYNE4Q8N205 404 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 PANK1Q8TE04 598 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 UTYO14607 1347 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 H7C1W4 665 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 PDE3AQ14432 1141 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 ERFEQ4G0M1 354 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 LAMB2P55268 1798 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 FAM89AQ96GI7 184 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 GRM8O00222 908 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 MS4A1P11836 297 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 USP44Q9H0E7 712 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-210ENST00000477812 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 ST5P78524 1137 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 MEIS3Q99687 375 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 NPHP1O15259 732 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 KAZALD1Q96I82 304 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 COG6Q9Y2V7 657 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 CRY2Q49AN0 593 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 SUCLG2Q96I99 432 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 PDE8AO60658 829 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 PDE6BP35913 854 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 FOXO4P98177 505 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 CTSWP56202 376 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 MYH3P11055 1940 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 GNAI3P08754 354 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 TGFB2P61812 414 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 NLRP3Q96P20 1036 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 SRGNP10124 158 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-210ENST00000477812 CSF1RP07333 972 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 KCNA3P22001 575 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 CHRNA5P30532 468 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-210ENST00000477812 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.07■■□□□ 1.6
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