RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476637.5

TBXAS1-216, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene TBXAS1, Length 623 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-216ENST00000476637 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.59■□□□□ 0.25
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TBXAS1-216ENST00000476637 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TBXAS1-216ENST00000476637 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TBXAS1-216ENST00000476637 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.58■□□□□ 0.24
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TBXAS1-216ENST00000476637 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.58■□□□□ 0.24
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TBXAS1-216ENST00000476637 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.54■□□□□ 0.24
TBXAS1-216ENST00000476637 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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TBXAS1-216ENST00000476637 SYNE4Q8N205 404 aa16.52■□□□□ 0.24
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TBXAS1-216ENST00000476637 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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TBXAS1-216ENST00000476637 TSPYL6Q8N831 410 aa16.46■□□□□ 0.23
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TBXAS1-216ENST00000476637 ZNF428Q96B54 188 aa16.45■□□□□ 0.22
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TBXAS1-216ENST00000476637 GPC2Q8N158 579 aa16.44■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.44■□□□□ 0.22
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TBXAS1-216ENST00000476637 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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TBXAS1-216ENST00000476637 CHADLQ6NUI6 762 aa16.43■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 TMC4Q7Z404 712 aa16.43■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.43■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 HACL1Q9UJ83 578 aa16.43■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 POTEIP0CG38 1075 aa16.42■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 POTEJP0CG39 1038 aa16.42■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 LDHDQ86WU2 507 aa16.42■□□□□ 0.22
TBXAS1-216ENST00000476637 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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