RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 FAM177BA6PVY3 158 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-211ENST00000476336 SLC10A5Q5PT55 438 aa17.14■□□□□ 0.33
PRAME-211ENST00000476336 SUSD4Q5VX71 490 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-211ENST00000476336 C7orf43Q8WVR3 580 aa17.05■□□□□ 0.32
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PRAME-211ENST00000476336 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
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PRAME-211ENST00000476336 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PRAME-211ENST00000476336 SLFN5Q08AF3 891 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-211ENST00000476336 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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PRAME-211ENST00000476336 LAMB2P55268 1798 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-211ENST00000476336 BBOX1O75936 387 aa17.03■□□□□ 0.32
PRAME-211ENST00000476336 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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PRAME-211ENST00000476336 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17■□□□□ 0.31
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PRAME-211ENST00000476336 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 G2E3Q7L622 706 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 LINS1Q8NG48 757 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 PSMD1Q99460 953 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-211ENST00000476336 GLTPD2A6NH11 291 aa16.99■□□□□ 0.31
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