RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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NISCH-205ENST00000467594 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CACNA1SQ13698 1873 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 RRAGCQ9HB90 399 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 HYPKQ9NX55 129 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 TCIRG1Q13488 830 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 NLRP3Q96P20 1036 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 MRS2Q9HD23 443 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CCDC27Q2M243 656 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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NISCH-205ENST00000467594 NLRP10Q86W26 655 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-205ENST00000467594 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.99■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 WWC1Q8IX03 1113 aa19.97■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-205ENST00000467594 PSMD1Q99460 953 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-205ENST00000467594 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
NISCH-205ENST00000467594 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.96■□□□□ 0.79
NISCH-205ENST00000467594 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.96■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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NISCH-205ENST00000467594 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 TMC4Q7Z404 712 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 TSPYL6Q8N831 410 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 FAM89AQ96GI7 184 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 STK31Q9BXU1 1019 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 VPS33BQ9H267 617 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-205ENST00000467594 GRAPQ13588 217 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 WDR63Q8IWG1 891 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 SP8Q8IXZ3 490 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.89■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
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NISCH-205ENST00000467594 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 LAMB2P55268 1798 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 ZNF541Q9H0D2 1346 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 MYD88Q99836 296 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 EIF6P56537 245 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 GPC2Q8N158 579 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 KSR2Q6VAB6 950 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 MPNDQ8N594 471 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 ZNF428Q96B54 188 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-205ENST00000467594 SCN4AP35499 1836 aa19.85■□□□□ 0.77
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