RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E9PCH4 1651 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDF10P55107 478 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNMO15061 1565 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFB5O43674 189 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCNN1DP51172 638 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNS4Q8IZW8 715 aa12.16□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMC7Q7Z402 723 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CITED4Q96RK1 184 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSBPL3Q9H4L5 887 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOS1P29475 1434 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPSTP25325 297 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHA4P54764 986 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IDI1Q13907 227 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.14□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIK3C2BO00750 1634 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INHAP05111 366 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT7BP56706 349 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf46Q6P387 395 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TREHO43280 583 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGD1P98174 961 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM32Q13049 653 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP1Q9C000 1473 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STRCQ7RTU9 1775 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAG2Q8N3U4 1231 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DRC1Q96MC2 740 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POTEMA6NI47 508 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETNK1Q9HBU6 452 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYLDQ9NQC7 956 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.08□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2R1Q13018 1463 aa12.08□□□□□ -0.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPN5P54829 565 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP2U1Q7Z449 544 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK15Q96Q40 435 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BACH2Q9BYV9 841 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PRU2 124 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNRH1P01148 92 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SKOR1P84550 965 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXK2Q01167 660 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMC1Q8TDI8 760 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STIM2Q9P246 746 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLTCL1P53675 1640 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADGRB3O60242 1522 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPRTO14522 1441 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTKP29376 864 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSC3Q14574 896 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FZD6O60353 706 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FSHRP23945 695 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCB3Q01970 1234 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AAMPQ13685 434 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARID5BQ14865 1188 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX20Q5RI15 118 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NJY4 79 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE3BQ13370 1112 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTFR1Q15390 333 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPM2O94759 1503 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms