RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442011.6

TGFBI-201, Transcript of transforming growth factor beta induced, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TGFBI, Length 2,804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBI-201ENST00000442011 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TGFBI-201ENST00000442011 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CCZ1BP86790 482 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 DDX11Q96FC9 970 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 NEMFO60524 1076 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 RAPGEF3O95398 923 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 GORABQ5T7V8 394 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 IQCB1Q15051 598 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 ALKQ9UM73 1620 aa14.63□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CYP2C19P33261 490 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 FOSBP53539 338 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CLCN6P51797 869 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 NECTIN1Q15223 517 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 SARM1Q6SZW1 724 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 FAM227BQ96M60 508 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 ARHGEF10O15013 1369 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TULP2O00295 520 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 JAK2O60674 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 STX1AQ16623 288 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 NEK11Q8NG66 645 aa14.61□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 NUTM2FA1L443 756 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 POLA2Q14181 598 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 H3BQV1 296 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 IFFO2Q5TF58 517 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 RNF20Q5VTR2 975 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.6□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 SLC27A2O14975 620 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 PSMA5P28066 241 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 CAVIN2O95810 425 aa14.59□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
TGFBI-201ENST00000442011 PLA2G4AP47712 749 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 BRF1Q92994 677 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 HOMER1Q86YM7 354 aa14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 SLC20A2Q08357 652 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 MAP3K5Q99683 1374 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.57□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 SMC2O95347 1197 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 ANKRD1Q15327 319 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 TEX35Q5T0J7 233 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 KCNB2Q92953 911 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TGFBI-201ENST00000442011 RPS6KB1P23443 525 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms