RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, human

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRC-208	ENST00000427110	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	OCLN	Q16625	522 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	BHMT	Q93088	406 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PTPRC-208	ENST00000427110	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	FOXO3	O43524	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SCNN1A	P37088	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	COL8A1	P27658	744 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	DGKG	P49619	791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	IDH3A	P50213	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	COX20	Q5RI15	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	MICAL2	O94851	1124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ADH7	P40394	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	KCNQ4	P56696	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	IER5	Q5VY09	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	MDFI	Q99750	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SIN3B	O75182	1162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ALB	P02768	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ITGB2	P05107	769 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	NFKB1	P19838	968 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	INPP5B	P32019	993 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	MYO19	Q96H55	970 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110		M0R082	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	GNB5	O14775	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SASH3	O75995	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ARSD	P51689	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	CCIN	Q13939	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	HIF1A	Q16665	826 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	OPLAH	O14841	1288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ALAS2	P22557	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	ZBTB39	O15060	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	EPB42	P16452	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRC-208	ENST00000427110	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRC-208	ENST00000427110	XYLB	O75191	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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