RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 FIBPO43427 364 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF790Q6PG37 636 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 MCM5P33992 734 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 MPNDQ8N594 471 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 HYPKQ9NX55 129 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 F13A1P00488 732 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 MTX1Q13505 466 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA3Q99758 1704 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 GJB2P29033 226 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 AACSQ86V21 672 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 GPATCH3Q96I76 525 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 USP16Q9Y5T5 823 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2HP62256 183 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 USP25Q9UHP3 1055 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 CABP4P57796 275 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 KSR2Q6VAB6 950 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 TERF1P54274 439 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH1L1O75891 902 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS53Q5VIR6 699 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JS52 829 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ4P48050 445 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 EVI5LQ96CN4 794 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM227BQ96M60 508 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 NECAB1Q8N987 351 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR6Q9Y217 621 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 C5P01031 1676 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRHP07919 91 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 IL2RBP14784 551 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SUCLG2Q96I99 432 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF5Q96JK2 942 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 NECTIN1Q15223 517 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ME3Q16798 604 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 UVSSAQ2YD98 709 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SASH1O94885 1247 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ST3GAL1Q11201 340 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SIL1Q9H173 461 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM8O00222 908 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY5O95622 1261 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 KAZALD1Q96I82 304 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PDIA6Q15084 440 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.29■■□□□ 1.16
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