RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 WDR78Q5VTH9 848 aa21.33■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 ZNF165P49910 485 aa21.33■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 CHMP4BP1P59074 171 aa21.33■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 CCDC102BQ68D86 513 aa21.32■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.32■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.32■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.32■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.32■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.31■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 HOOK3Q86VS8 718 aa21.31■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 CABP5Q9NP86 173 aa21.31■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 MCM5P33992 734 aa21.3■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.3■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.29■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.29■■□□□ 1
USP25-204ENST00000400183 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.29■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 POTEB2H3BUK9 544 aa21.28■■□□□ 1
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USP25-204ENST00000400183 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
USP25-204ENST00000400183 MAP3K1Q13233 1512 aa21.23■□□□□ 0.99
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USP25-204ENST00000400183 PPFIA3O75145 1194 aa21.23■□□□□ 0.99
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