RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM177BA6PVY3 158 aa19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYD88Q99836 296 aa19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.5■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.49■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP3Q96P20 1036 aa19.46■□□□□ 0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNKSR1Q969H4 720 aa19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.44■□□□□ 0.7
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF16BQ96L93 1317 aa19.44■□□□□ 0.7
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCS1LQ9Y276 419 aa19.43■□□□□ 0.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH1B1P30837 517 aa19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.41■□□□□ 0.7
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.38■□□□□ 0.69
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.36■□□□□ 0.69
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G12BQ9BX93 195 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP98P52948 1817 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM8O00222 908 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBOX1O75936 387 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CASP7P55210 303 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCAR3O75815 825 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSWP56202 376 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMC4Q7Z404 712 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C7orf43Q8WVR3 580 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UTYO14607 1347 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C21orf2O43822 256 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRAPQ13588 217 aa19.32■□□□□ 0.68
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