RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 PARP10Q53GL7 1025 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 GNAI3P08754 354 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 GCKRQ14397 625 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 MSH5O43196 834 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 GYS1P13807 737 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 NLRP10Q86W26 655 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 SETDB2Q96T68 719 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 USP44Q9H0E7 712 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 UTYO14607 1347 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 GRM8O00222 908 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 FKBP8Q14318 412 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 GPTP24298 496 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 CHD4Q14839 1912 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-202ENST00000395560 H7C1W4 665 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 KLHL34Q8N239 644 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 NYXQ9GZU5 481 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 MEIS3Q99687 375 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 TM4SF1P30408 202 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 GNAI2P04899 355 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 NFIXQ14938 502 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 SUSD4Q5VX71 490 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 MSL1Q68DK7 614 aa22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.41■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 NTSR2O95665 410 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 CASP7P55210 303 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.4■■□□□ 1.18
UPP1-202ENST00000395560 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 FAM89AQ96GI7 184 aa22.38■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 POLD1P28340 1107 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.37■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 SERPINB2P05120 415 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.36■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 FAM177BA6PVY3 158 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 NPHP1O15259 732 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 GPR162Q16538 588 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 SUCLG2Q96I99 432 aa22.35■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 PDE8AO60658 829 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 MMP10P09238 476 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 CNBD1Q8NA66 436 aa22.34■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 ST5P78524 1137 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 DDR1Q08345 913 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.33■■□□□ 1.17
UPP1-202ENST00000395560 LAMB2P55268 1798 aa22.33■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 MTX1Q13505 466 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 ERFEQ4G0M1 354 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 KAZALD1Q96I82 304 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.32■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 FOXO4P98177 505 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 ATP8B2P98198 1209 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 CEP85Q6P2H3 762 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.31■■□□□ 1.16
UPP1-202ENST00000395560 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms