RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 UTRNP46939 3433 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ERFEQ4G0M1 354 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 GRIN3BO60391 1043 aa26.09■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.08■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 SRGNP10124 158 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 MYD88Q99836 296 aa26.07■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 BCS1LQ9Y276 419 aa26.06■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 CRY2Q49AN0 593 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 STYK1Q6J9G0 422 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 MASTLQ96GX5 879 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 TTLL6Q8N841 843 aa26.04■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 CHD4Q14839 1912 aa26.04■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 IGKV5-2P06315 115 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.03■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 NPR1P16066 1061 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 LAMB2P55268 1798 aa26.02■■□□□ 1.76
CLDN3-201ENST00000395145 SYNE4Q8N205 404 aa26.01■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 CNKSR1Q969H4 720 aa26.01■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 NLRP3Q96P20 1036 aa26■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 CACNA1SQ13698 1873 aa26■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 FAM89AQ96GI7 184 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 SLX4Q8IY92 1834 aa25.99■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 PTPRCP08575 1304 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 LINS1Q8NG48 757 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.98■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 F6X3S4 739 aa25.97■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.97■■□□□ 1.75
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CLDN3-201ENST00000395145 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLDN3-201ENST00000395145 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 ALDH1B1P30837 517 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 BEND3Q5T5X7 828 aa25.95■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 GCKRQ14397 625 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.92■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 H7C1W4 665 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.91■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 MYH3P11055 1940 aa25.9■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 C21orf2O43822 256 aa25.89■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 PDE8AO60658 829 aa25.89■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 ALDH1L1O75891 902 aa25.89■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 SOGA3Q5TF21 947 aa25.89■■□□□ 1.74
CLDN3-201ENST00000395145 KIF16BQ96L93 1317 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 CASP7P55210 303 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC4O15439 1325 aa25.88■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.87■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 SBF1O95248 1867 aa25.87■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 TAF1P21675 1872 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.85■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 NFKBIEO00221 500 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 YY1P25490 414 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 GRAPQ13588 217 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC93Q567U6 631 aa25.84■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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