RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 FAM89AQ96GI7 184 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 NUP98P52948 1817 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 H7C1W4 665 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 ZPR1O75312 459 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 SUSD4Q5VX71 490 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-202ENST00000394765 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 C4AP0C0L4 1744 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 BCORQ6W2J9 1755 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 SSFA2P28290 1259 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 SCN7AQ01118 1682 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ADRA2BP18089 450 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 MSH5O43196 834 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 GYS1P13807 737 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ATP8B2P98198 1209 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.176e-7■■□□□ 13.1
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UBXN6-202ENST00000394765 SLC15A2Q16348 729 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-202ENST00000394765 SRGAP3O43295 1099 aa22.33■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 FOXO4P98177 505 aa22.33■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 ILDR2Q71H61 639 aa22.33■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.33■■□□□ 1.16
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UBXN6-202ENST00000394765 NTSR2O95665 410 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 NFIXQ14938 502 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.31■■□□□ 1.16
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UBXN6-202ENST00000394765 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC125Q86Z20 511 aa22.3■■□□□ 1.16
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UBXN6-202ENST00000394765 PARP10Q53GL7 1025 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 SSH3Q8TE77 659 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 SETDB2Q96T68 719 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 MTX1Q13505 466 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 POLA2Q14181 598 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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UBXN6-202ENST00000394765 MSL1Q68DK7 614 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 SMC5Q8IY18 1101 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 DCTPP1Q9H773 170 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-202ENST00000394765 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.27■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC12Q96J65 1359 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 RGL2O15211 777 aa22.26■■□□□ 1.15
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UBXN6-202ENST00000394765 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 HMMRO75330 724 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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UBXN6-202ENST00000394765 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 FAM161AQ3B820 660 aa22.24■■□□□ 1.15
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UBXN6-202ENST00000394765 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 SIL1Q9H173 461 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 PDE8AO60658 829 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 CTSWP56202 376 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 GCC1Q96CN9 775 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 GREM2Q9H772 168 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-202ENST00000394765 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.22■■□□□ 1.15
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