RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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CBX1-202ENST00000393408 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CBX1-202ENST00000393408 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CBX1-202ENST00000393408 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CBX1-202ENST00000393408 DTNBO60941 627 aa22.53■■□□□ 1.2
CBX1-202ENST00000393408 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.53■■□□□ 1.2
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CBX1-202ENST00000393408 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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CBX1-202ENST00000393408 SLC27A2O14975 620 aa22.51■■□□□ 1.19
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CBX1-202ENST00000393408 MED23Q9ULK4 1368 aa22.49■■□□□ 1.19
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CBX1-202ENST00000393408 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.49■■□□□ 1.19
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CBX1-202ENST00000393408 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.48■■□□□ 1.19
CBX1-202ENST00000393408 RGPD5Q99666 1765 aa22.48■■□□□ 1.19
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CBX1-202ENST00000393408 SIL1Q9H173 461 aa22.48■■□□□ 1.19
CBX1-202ENST00000393408 JCADQ9P266 1359 aa22.48■■□□□ 1.19
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CBX1-202ENST00000393408 MYD88Q99836 296 aa22.4■■□□□ 1.18
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CBX1-202ENST00000393408 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.4■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 CCDC192P0DO97 292 aa22.4■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.4■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 COPS6Q7L5N1 327 aa22.4■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.39■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CBX1-202ENST00000393408 MAP7D2Q96T17 732 aa22.39■■□□□ 1.18
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