RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, human

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAPK9-204	ENST00000393362	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		43.29	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		43.27	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	OLFM4	Q6UX06	510 aa		43.27	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		43.27	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	CACNA1S	Q13698	1873 aa		43.26	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	ALDH1B1	P30837	517 aa		43.26	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		43.26	■■■■■ 4.52
MAPK9-204	ENST00000393362	SYNE4	Q8N205	404 aa		43.25	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		43.25	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		43.25	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	SOGA3	Q5TF21	947 aa		43.24	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		43.24	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		43.23	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	IL16	Q14005	1332 aa		43.22	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF428	Q96B54	188 aa		43.22	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		43.21	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC93	Q567U6	631 aa		43.21	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		43.21	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	NLRP3	Q96P20	1036 aa		43.2	■■■■■ 4.51
MAPK9-204	ENST00000393362	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		43.18	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		43.18	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		43.17	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		43.17	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		43.17	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		43.17	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	RRAGC	Q9HB90	399 aa		43.16	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	GLTPD2	A6NH11	291 aa		43.15	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	WDR63	Q8IWG1	891 aa		43.15	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		43.13	■■■■■ 4.5
MAPK9-204	ENST00000393362	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	43.13	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC51A	Q86UW1	340 aa		43.13	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		43.12	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		43.12	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		43.11	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	GOLGA2	Q08379	1002 aa		43.1	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	SNED1	Q8TER0	1413 aa		43.09	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	TOMM70	O94826	608 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	FAM89A	Q96GI7	184 aa		43.08	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
MAPK9-204	ENST00000393362	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		43.05	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		43.04	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	ABCC4	O15439	1325 aa		43.03	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	POTEC	B2RU33	542 aa		43.02	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		43.02	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	MYD88	Q99836	296 aa		43.02	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	PSMD1	Q99460	953 aa		43.01	■■■■■ 4.48
MAPK9-204	ENST00000393362	G2E3	Q7L622	706 aa		43	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	VAMP4	O75379	141 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	STK31	Q9BXU1	1019 aa		42.99	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC4A2	P04920	1241 aa		42.98	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	LAMB2	P55268	1798 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	HSPA6	P17066	643 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	KSR2	Q6VAB6	950 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		42.96	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	BBOX1	O75936	387 aa		42.96	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		42.96	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		42.95	■■■■■ 4.47
MAPK9-204	ENST00000393362	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		42.94	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	GRAP	Q13588	217 aa		42.93	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF521	Q96K83	1311 aa		42.92	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	SP8	Q8IXZ3	490 aa		42.91	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	IGKV5-2	P06315	115 aa		42.9	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		42.88	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	WDR90	Q96KV7	1748 aa		42.88	■■■■■ 4.46
MAPK9-204	ENST00000393362	FZD9	O00144	591 aa		42.88	■■■■■ 4.45
MAPK9-204	ENST00000393362	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms