RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 EMP3P54852 163 aa9.33□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TEFQ10587 303 aa9.33□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.33□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.33□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 STARD3NLO95772 234 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 PPP2R1AP30153 589 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CFAP53Q96M91 514 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 HSPA6P17066 643 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.32□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 SCN7AQ01118 1682 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 POTEB3A0JP26 581 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 KCNQ3O43525 872 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 SERPINB2P05120 415 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 POTEBQ6S5H4 581 aa9.31□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 NUDCQ9Y266 331 aa9.3□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 A0A087WZG4 1122 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 BTBD11A6QL63 1104 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TOMM70O94826 608 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CAMTA2O94983 1202 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 A1BGP04217 495 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 RNF181Q9P0P0 153 aa9.29□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 PRELPP51888 382 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 RASSF7Q02833 373 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 MCM10Q7L590 875 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.28□□□□□ -0.92
CTXN3-201ENST00000379445 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 FAM205CA6NFA0 338 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 DCTN1Q14203 1278 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 USP16Q9Y5T5 823 aa9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 H0YIN7 160 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 NFKBIEO00221 500 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 TTLL6Q8N841 843 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 BCORQ6W2J9 1755 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 MTMR7Q9Y216 660 aa9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 NBPF26B4DH59 902 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 LMNB1P20700 586 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 NBPF15Q8N660 670 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.25□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 PDE6BP35913 854 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 APLP1P51693 650 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 FLIIQ13045 1269 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 MICALL2Q8IY33 904 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 CNBD1Q8NA66 436 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 SETDB2Q96T68 719 aa9.24□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 DOK7Q18PE1 504 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 SBF1O95248 1867 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 SRGNP10124 158 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 FSTL1Q12841 308 aa9.23□□□□□ -0.93
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.23□□□□□ -0.93
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