RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376350.7

PTPRH-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-202ENST00000376350 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 MRE11P49959 708 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TIMM10P62072 90 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 LTN1O94822 1766 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SDSP20132 328 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 PDE1AP54750 535 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 MCCP23508 829 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 WASHC4Q2M389 1173 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TFCP2Q12800 502 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 FBXW7Q969H0 707 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 APBA3O96018 575 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 PDIA6Q15084 440 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 CNTROBQ8N137 903 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 NWD1Q149M9 1564 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 ADCY9O60503 1353 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 STRCQ7RTU9 1775 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 KIF1AQ12756 1690 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TCIRG1Q13488 830 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 PALLDQ8WX93 1383 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 APPP05067 770 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TTC22Q5TAA0 569 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SNX21Q969T3 373 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 SETDB2Q96T68 719 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 RAB11FIP3O75154 756 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 REC8O95072 547 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 TOMM22Q9NS69 142 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRH-202ENST00000376350 NCAPD2Q15021 1401 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 VPS72Q15906 364 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 G3V3G9 751 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ST18O60284 1047 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 KIF2CQ99661 725 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 MSL1Q68DK7 614 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 LRRC24Q50LG9 513 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 GOLIM4O00461 696 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 TAF5LO75529 589 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ITPK1Q13572 414 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 JAG2Q9Y219 1238 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 RABEP1Q15276 862 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ITGA6P23229 1130 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ABCF2Q9UG63 623 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 NEK4P51957 841 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 SSH3Q8TE77 659 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 SLIT3O75094 1523 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 PKP1Q13835 747 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 SNAP23O00161 211 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRH-202ENST00000376350 RXRBP28702 533 aa16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms