RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 NLRP10Q86W26 655 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-202ENST00000375150 IGHDP01880 384 aa23.64■■□□□ 1.38
PRRT1-202ENST00000375150 AKT1S1Q96B36 256 aa23.64■■□□□ 1.38
PRRT1-202ENST00000375150 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PRRT1-202ENST00000375150 H7C1W4 665 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 HMMRO75330 724 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 PARP10Q53GL7 1025 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.64■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF827Q17R98 1081 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 SUCLG2Q96I99 432 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 CASP7P55210 303 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.61■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 ATP8B2P98198 1209 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.6■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 MTX1Q13505 466 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 KAZALD1Q96I82 304 aa23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PRRT1-202ENST00000375150 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.58■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 FAM89AQ96GI7 184 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 STK32BQ9NY57 414 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SRGAP3O43295 1099 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SUSD4Q5VX71 490 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 GCC1Q96CN9 775 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SETDB2Q96T68 719 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SMC5Q8IY18 1101 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SSH3Q8TE77 659 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 POLA2Q14181 598 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 SLC15A2Q16348 729 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 NTSR2O95665 410 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 GYS1P13807 737 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 DCTPP1Q9H773 170 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 MYH3P11055 1940 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 FAM177BA6PVY3 158 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 MSH5O43196 834 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 NYXQ9GZU5 481 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 LAMB2P55268 1798 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 FOXO4P98177 505 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-202ENST00000375150 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.5■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 SYNE4Q8N205 404 aa23.5■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 PDE8AO60658 829 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NFIXQ14938 502 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 CTSWP56202 376 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NUCB1Q02818 461 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-202ENST00000375150 NPHP1O15259 732 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CSF1RP07333 972 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 TM4SF1P30408 202 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 ERFEQ4G0M1 354 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 RAB11FIP3O75154 756 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 CNBD1Q8NA66 436 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 COPRSQ9NQ92 184 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-202ENST00000375150 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms