RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369214.2

PRDM13-201, Transcript of PR/SET domain 13, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM13, Length 3,232 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM13-201ENST00000369214 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 FAM227BQ96M60 508 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 TPM3P06753 285 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 PSMA5P28066 241 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 KRT85P78386 507 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 TTC6Q86TZ1 520 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 SNRKQ9NRH2 765 aa22.14■■□□□ 1.14
PRDM13-201ENST00000369214 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 SLC27A2O14975 620 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PROSER3Q2NL68 480 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 ELP1O95163 1332 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 SASH1O94885 1247 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PDCP20941 246 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 ANKRD1Q15327 319 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 SUCLG2Q96I99 432 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 MAP3K11Q16584 847 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 GRM8O00222 908 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 FERMT3Q86UX7 667 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 LINS1Q8NG48 757 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 NCAPD2Q15021 1401 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 RNF20Q5VTR2 975 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 KAZALD1Q96I82 304 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 UTYO14607 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 LIG1P18858 919 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.1■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 A0A0D9SFI3 127 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 RPS6KB1P23443 525 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 SPC24Q8NBT2 197 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 TYRO3Q06418 890 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 TSC1Q92574 1164 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 FSD1Q9BTV5 496 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM13-201ENST00000369214 PXDNQ92626 1479 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 MED23Q9ULK4 1368 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 ARID3AQ99856 593 aa22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 KIF3AQ9Y496 699 aa22.07■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CAMK4Q16566 473 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.06■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 JCADQ9P266 1359 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TNMDQ9H2S6 317 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 SPATA32Q96LK8 384 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 DACT1Q9NYF0 836 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 LUZP1Q86V48 1076 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 SIL1Q9H173 461 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.03■■□□□ 1.12
PRDM13-201ENST00000369214 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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