RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 KAZALD1Q96I82 304 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 PSMA5P28066 241 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 KCNJ4P48050 445 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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SPNS3-201ENST00000355530 ST3GAL1Q11201 340 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 ME3Q16798 604 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
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SPNS3-201ENST00000355530 MED23Q9ULK4 1368 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SPNS3-201ENST00000355530 USP25Q9UHP3 1055 aa21.78■■□□□ 1.08
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SPNS3-201ENST00000355530 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-201ENST00000355530 KIF1AQ12756 1690 aa21.77■■□□□ 1.08
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SPNS3-201ENST00000355530 PDCP20941 246 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-201ENST00000355530 IGKV5-2P06315 115 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-201ENST00000355530 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-201ENST00000355530 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 NECAB1Q8N987 351 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 KRT85P78386 507 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 ORAI2Q96SN7 254 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 ELP1O95163 1332 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPNS3-201ENST00000355530 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS3-201ENST00000355530 ALS2Q96Q42 1657 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 MAP7D2Q96T17 732 aa21.7■■□□□ 1.06
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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SPNS3-201ENST00000355530 MYD88Q99836 296 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 DTNBO60941 627 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 ATP5JP18859 108 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 SLC39A6Q13433 755 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 TAF5LO75529 589 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS3-201ENST00000355530 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.66■■□□□ 1.06
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