RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN4-201ENST00000340958 LRP5O75197 1615 aa21.52■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 HLFQ16534 295 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 SSH3Q8TE77 659 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 GPTP24298 496 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 POLA2Q14181 598 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 COL15A1P39059 1388 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 H7C1W4 665 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 PDE4AP27815 886 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 GNPATO15228 680 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 MTX1Q13505 466 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 AK7Q96M32 723 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZBTB7AO95365 584 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 KAZALD1Q96I82 304 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
CLDN4-201ENST00000340958 RAB11FIP3O75154 756 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 SMIM5Q71RC9 77 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 NLRP10Q86W26 655 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 RPS6KA4O75676 772 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 CAMTA2O94983 1202 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 FAM89AQ96GI7 184 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 CASP7P55210 303 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 FAM161AQ3B820 660 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 ZPR1O75312 459 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 PHF14O94880 888 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
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CLDN4-201ENST00000340958 SPON1Q9HCB6 807 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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CLDN4-201ENST00000340958 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 MTFR1LQ9H019 292 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 SSFA2P28290 1259 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 FOXO4P98177 505 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 PARP10Q53GL7 1025 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 SIL1Q9H173 461 aa21.39■■□□□ 1.02
CLDN4-201ENST00000340958 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
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CLDN4-201ENST00000340958 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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CLDN4-201ENST00000340958 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.38■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 BACH2Q9BYV9 841 aa21.38■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 NUP98P52948 1817 aa21.37■■□□□ 1.01
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CLDN4-201ENST00000340958 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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CLDN4-201ENST00000340958 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.36■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.36■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.36■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 SUSD4Q5VX71 490 aa21.36■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.35■■□□□ 1.01
CLDN4-201ENST00000340958 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.35■■□□□ 1.01
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