RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 C21orf2O43822 256 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF521Q96K83 1311 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFKBIEO00221 500 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRELPP51888 382 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA2Q08379 1002 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF181Q9P0P0 153 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA1FO60840 1977 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMNB1P20700 586 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNE4Q8N205 404 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF428Q96B54 188 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK31Q9BXU1 1019 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH1B1P30837 517 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOGA3Q5TF21 947 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNED1Q8TER0 1413 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAMP4O75379 141 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP3Q96P20 1036 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC93Q567U6 631 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 OLFM4Q6UX06 510 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 G2E3Q7L622 706 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYD88Q99836 296 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC4A2P04920 1241 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KSR2Q6VAB6 950 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM89AQ96GI7 184 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC51AQ86UW1 340 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC4O15439 1325 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF1P21675 1872 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLIIQ13045 1269 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF3CO14782 793 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIER1Q8N108 512 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL4A1P02462 1669 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV5-2P06315 115 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PSI1 815 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF8P60827 252 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLFN5Q08AF3 891 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD1Q99460 953 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAPQ13588 217 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLTPD2A6NH11 291 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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