RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 NLRP3Q96P20 1036 aa26.29■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 NUP98P52948 1817 aa26.29■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 CACNA1SQ13698 1873 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC9B-201ENST00000311308 KRT24Q2M2I5 525 aa26.26■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 APAF1O14727 1248 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 SYNE4Q8N205 404 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 OLFM4Q6UX06 510 aa26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 PSMD1Q99460 953 aa26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 WDR90Q96KV7 1748 aa26.24■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 TCIRG1Q13488 830 aa26.23■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.23■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 POTECB2RU33 542 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 GNAI1P63096 354 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 JDP2Q8WYK2 163 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 IFT57Q9NWB7 429 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 NLRP10Q86W26 655 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 MBIPQ9NS73 344 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 HYPKQ9NX55 129 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC9B-201ENST00000311308 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.2■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.2■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.19■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.19■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF853P0CG23 659 aa26.18■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.17■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 KLRG1Q96E93 195 aa26.17■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 FZD9O00144 591 aa26.16■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 HTRA3P83110 453 aa26.16■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 CHADLQ6NUI6 762 aa26.16■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 BBOX1O75936 387 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 SNED1Q8TER0 1413 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC9B-201ENST00000311308 ABCC4O15439 1325 aa26.14■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 GOLGA2Q08379 1002 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 LDHDQ86WU2 507 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 GPC2Q8N158 579 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 HACL1Q9UJ83 578 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 VPS33BQ9H267 617 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 ANP32CO43423 234 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 TMC4Q7Z404 712 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 NIM1KQ8IY84 436 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 PPIP5K2O43314 1243 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 GRAPQ13588 217 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 SP8Q8IXZ3 490 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 EPHX2P34913 555 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC9B-201ENST00000311308 SCN4AP35499 1836 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 POTEIP0CG38 1075 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 POTEJP0CG39 1038 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC27Q2M243 656 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 JMYQ8N9B5 988 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 FAM89AQ96GI7 184 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 MPNDQ8N594 471 aa26.06■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.05■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 MRS2Q9HD23 443 aa26.05■■□□□ 1.76
TTC9B-201ENST00000311308 AOC3Q16853 763 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms