RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303004.4

CEBPB-201, Transcript of CCAAT enhancer binding protein beta, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CEBPB, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPB-201ENST00000303004 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.45■■■□□ 2.15
CEBPB-201ENST00000303004 JCADQ9P266 1359 aa28.45■■■□□ 2.15
CEBPB-201ENST00000303004 CPA1P15085 419 aa28.45■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ANKRD1Q15327 319 aa28.44■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 RNF20Q5VTR2 975 aa28.44■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ABCC6O95255 1503 aa28.43■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 MED23Q9ULK4 1368 aa28.43■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ME3Q16798 604 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 IGKV5-2P06315 115 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ST3GAL1Q11201 340 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.42■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 SLC27A2O14975 620 aa28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 COL15A1P39059 1388 aa28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 PDCP20941 246 aa28.41■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 KIF1AQ12756 1690 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 FIBPO43427 364 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 PTMAP06454 111 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF790Q6PG37 636 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 FAM227BQ96M60 508 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ORAI2Q96SN7 254 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 ERBB3P21860 1342 aa28.4■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.39■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.39■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CEBPB-201ENST00000303004 KCNJ4P48050 445 aa28.39■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.39■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.39■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 ELP1O95163 1332 aa28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 GCKRQ14397 625 aa28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 FSD1Q9BTV5 496 aa28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 COPRSQ9NQ92 184 aa28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.36■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 A0A0D9SFI3 127 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 RPS6KB1P23443 525 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 C5P01031 1676 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.34■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KDM4AO75164 1064 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KRT85P78386 507 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 KRT32Q14532 448 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 ATP5JP18859 108 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 USP25Q9UHP3 1055 aa28.33■■■□□ 2.13
CEBPB-201ENST00000303004 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 ADCY5O95622 1261 aa28.32■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.32■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.31■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 ALS2Q96Q42 1657 aa28.31■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 NECAB1Q8N987 351 aa28.31■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 PHKG2P15735 406 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 TAF5LO75529 589 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 MAP7D2Q96T17 732 aa28.3■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 COPS6Q7L5N1 327 aa28.29■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 TICAM2Q86XR7 235 aa28.29■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 SIL1Q9H173 461 aa28.29■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC192P0DO97 292 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 MYD88Q99836 296 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 RGPD5Q99666 1765 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 DYNC1I1O14576 645 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.28■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 TPM3P06753 285 aa28.27■■■□□ 2.12
CEBPB-201ENST00000303004 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
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