RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 HMOX1P09601 288 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKZQ13574 1117 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 NYXQ9GZU5 481 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1B-201ENST00000296642 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 NIM1KQ8IY84 436 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD11A6QL63 1104 aa10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 A1BGP04217 495 aa10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 NOGQ13253 232 aa10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS33BQ9H267 617 aa10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.56□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 TSKSQ9UJT2 592 aa10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.55□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 BCORQ6W2J9 1755 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM177BA6PVY3 158 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 EPS15P42566 896 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SCNN1DP51172 638 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 GCC1Q96CN9 775 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIP5K2O43314 1243 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 AOC2O75106 756 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 CST9Q5W186 159 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-201ENST00000296642 H7C1D1 291 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 TNIP1Q15025 636 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF15Q8N660 670 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17REQ8NFR9 667 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC102AQ96A19 550 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF5O00463 557 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CRY2Q49AN0 593 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 OLFM4Q6UX06 510 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNRF3Q9ULT6 936 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 USP16Q9Y5T5 823 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVV-1B6SEH8 477 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HUNKP57058 714 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP53Q96M91 514 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDCQ9Y266 331 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 LTBP1Q14766 1721 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NEFMP07197 916 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP3Q96P20 1036 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 RGMBQ6NW40 437 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 BBOX1O75936 387 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX10P56693 466 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL9Q07325 125 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 AOC3Q16853 763 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.47□□□□□ -0.73
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