RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296387.5

CLDN19-201, Transcript of claudin 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN19, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19-201ENST00000296387 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 A0A0D9SFI3 127 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KCNA6P17658 529 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 EVI5LQ96CN4 794 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 SLC27A2O14975 620 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 SASH1O94885 1247 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.07■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC192P0DO97 292 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KCNB2Q92953 911 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 SUCLG2Q96I99 432 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 PTGS1P23219 599 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 MTX1Q13505 466 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 GPATCH3Q96I76 525 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 TBX22Q9Y458 520 aa15.06■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.05■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 MAP4K1Q92918 833 aa15.05■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KAZALD1Q96I82 304 aa15.05■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.05■□□□□ 0
CLDN19-201ENST00000296387 KRT85P78386 507 aa15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 DACT1Q9NYF0 836 aa15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.05■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 TYRO3Q06418 890 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 KIF3AQ9Y496 699 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 MAP3K11Q16584 847 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 IP6K1Q92551 441 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 FSD1Q9BTV5 496 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.04■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 CHGBP05060 677 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 HOXB7P09629 217 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 LRMPQ12912 555 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 KSR2Q6VAB6 950 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.03■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 CBX1P83916 185 aa15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 TNMDQ9H2S6 317 aa15.02■□□□□ -0
CLDN19-201ENST00000296387 JAK2O60674 1132 aa15.02□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 DDX11Q96FC9 970 aa15.02□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 SPATA32Q96LK8 384 aa15.02□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 CBX8Q9HC52 389 aa15.02□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 GRM8O00222 908 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 ALDH1L1O75891 902 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 LTN1O94822 1766 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PXDNQ92626 1479 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 RPS6KB1P23443 525 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 NR1I2O75469 434 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PSMA5P28066 241 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 ATP2B3Q16720 1220 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 DRC7Q8IY82 874 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PHF8Q9UPP1 1060 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 SLIT1O75093 1534 aa15□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 FOSBP53539 338 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PGBD1Q96JS3 809 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.99□□□□□ -0.01
CLDN19-201ENST00000296387 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms