RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CCDC171Q6TFL3 1326 aa33.57■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 NECTIN1Q15223 517 aa33.57■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 CNPY2Q9Y2B0 182 aa33.57■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 RRP9O43818 475 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 SUCLG2Q96I99 432 aa33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 SNRKQ9NRH2 765 aa33.56■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33.55■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 BRINP3Q76B58 766 aa33.54■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 KAZALD1Q96I82 304 aa33.53■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 SASH1O94885 1247 aa33.52■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 ADCK5Q3MIX3 580 aa33.52■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa33.52■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 LARGE1O95461 756 aa33.52■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 CPA1P15085 419 aa33.52■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 GJB2P29033 226 aa33.51■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 MAP4K1Q92918 833 aa33.51■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
UBP1-201ENST00000283628 CCDC83Q8IWF9 413 aa33.51■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 MRC1P22897 1456 aa33.5■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 PDIA6Q15084 440 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 PSMA5P28066 241 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 CREB3L3Q68CJ9 461 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 MTMR6Q9Y217 621 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 CPDO75976 1380 aa33.49■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.48■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa33.48■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 C5P01031 1676 aa33.46■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ4P48050 445 aa33.46■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 NEXNQ0ZGT2 675 aa33.46■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 RIC3Q7Z5B4 369 aa33.46■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 IGKV5-2P06315 115 aa33.45■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 RNF20Q5VTR2 975 aa33.45■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 FAM227BQ96M60 508 aa33.45■■■□□ 2.95
UBP1-201ENST00000283628 ME3Q16798 604 aa33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 ZNF790Q6PG37 636 aa33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 FIBPO43427 364 aa33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.44■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 PTMAP06454 111 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD1Q15327 319 aa33.43■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 SLC27A2O14975 620 aa33.43■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 MED23Q9ULK4 1368 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 NEURL1BA8MQ27 555 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 ST3GAL1Q11201 340 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 SLAIN2Q9P270 581 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 JCADQ9P266 1359 aa33.42■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 FSD1Q9BTV5 496 aa33.41■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.41■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 GCKRQ14397 625 aa33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 CHRNA2Q15822 529 aa33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 HMG20BQ9P0W2 317 aa33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 TPCN1Q9ULQ1 816 aa33.4■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 MEGF6O75095 1541 aa33.39■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 PDCP20941 246 aa33.39■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
UBP1-201ENST00000283628 A0A0D9SFI3 127 aa33.38■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.931e-6■□□□□ 10.3
UBP1-201ENST00000283628 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa33.38■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 BOLA2Q9H3K6 86 aa33.38■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 TSGA10IPQ3SY00 556 aa33.37■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 SIL1Q9H173 461 aa33.37■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 FUCA2Q9BTY2 467 aa33.36■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 KIAA2012Q0VF49 1180 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 XAGE3Q8WTP9 111 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 COPRSQ9NQ92 184 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 COL15A1P39059 1388 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 RPS6KB1P23443 525 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 NECAB1Q8N987 351 aa33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP33.35■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 RFX7Q2KHR2 1363 aa33.34■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.34■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 SLC39A6Q13433 755 aa33.33■■■□□ 2.93
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