RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 PHOX2BQ99453 314 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 KIF2CQ99661 725 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 PIK3C2AO00443 1686 aa9.6□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 TRAK2O60296 914 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 KCNA6P17658 529 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 NUCB2P80303 420 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-201ENST00000265616 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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UBXN8-201ENST00000265616 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.59□□□□□ -0.87
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UBXN8-201ENST00000265616 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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UBXN8-201ENST00000265616 RCCD1A6NED2 376 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 GNAI3P08754 354 aa9.58□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 ANAPC15P60006 121 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 WNT2BQ93097 391 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 USP26Q9BXU7 913 aa9.56□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 NWD1Q149M9 1564 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.56□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 NCAPD2Q15021 1401 aa9.55□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.55□□□□□ -0.88
UBXN8-201ENST00000265616 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 ZNF787Q6DD87 383 aa9.53□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.53□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.53□□□□□ -0.88
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UBXN8-201ENST00000265616 RAB11FIP3O75154 756 aa9.52□□□□□ -0.89
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UBXN8-201ENST00000265616 BCAMP50895 628 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 ATP8B2P98198 1209 aa9.52□□□□□ -0.89
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UBXN8-201ENST00000265616 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 MST1RQ04912 1400 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 FBLN1P23142 703 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 CLCN1P35523 988 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 PDE1AP54750 535 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF445P59923 1031 aa9.51□□□□□ -0.89
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