RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265175.5

SEC24B-201, Transcript of SEC24 homolog B, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24B, Length 5,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24B-201ENST00000265175 IDEP14735 1019 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 EVCP57679 992 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 DRC1Q96MC2 740 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TNNQ9UQP3 1299 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 A0A1B0GUL7 405 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE9A4FU28 777 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RLBP1P12271 317 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 KANK3Q6NY19 840 aa14.58□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 MICU3Q86XE3 530 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC114Q96M63 670 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 USP5P45974 858 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 PIP4K2BP78356 416 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC6Q16204 474 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 MEIS3Q99687 375 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 IFNKQ9P0W0 207 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 PTPRCP08575 1304 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CABP4P57796 275 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 SMARCA4P51532 1647 aa14.57□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 UBA7P41226 1012 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 HAND2P61296 217 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC96Q2M329 555 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 HOOK3Q86VS8 718 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TUBBP07437 444 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 METTL24Q5JXM2 366 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.56□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF445P59923 1031 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 MSL1Q68DK7 614 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TIAM1Q13009 1591 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 FSD2A1L4K1 749 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 PRXQ9BXM0 1461 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TUBB4BP68371 445 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TRIM47Q96LD4 638 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 SPAG1Q07617 926 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 SCLT1Q96NL6 688 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.55□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 9.7
SEC24B-201ENST00000265175 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ELF2Q15723 593 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 DAPK1P53355 1430 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 NAA25Q14CX7 972 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 IQCA1Q86XH1 822 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.54□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 NLRP5P59047 1200 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 HDXQ7Z353 690 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 MBIPQ9NS73 344 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 GOLIM4O00461 696 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 AFMP43652 599 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CEP63Q96MT8 703 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 RAB34Q9BZG1 259 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 TACC1O75410 805 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.53□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 A0A1B0GUA9 196 aa14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 POTEJP0CG39 1038 aa14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF76P36508 570 aa14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.52□□□□□ -0.08
SEC24B-201ENST00000265175 IL16Q14005 1332 aa14.52□□□□□ -0.09
SEC24B-201ENST00000265175 AK2P54819 239 aa14.52□□□□□ -0.09
SEC24B-201ENST00000265175 SNRKQ9NRH2 765 aa14.52□□□□□ -0.09
SEC24B-201ENST00000265175 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123 ms