RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 EYA1Q99502 592 aa27.47■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 CACNA1FO60840 1977 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.46■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.45■■□□□ 1.99
SLC9A3-201ENST00000264938 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 BICD2Q8TD16 824 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 ST7Q9NRC1 585 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM227BQ96M60 508 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 PDCP20941 246 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 IQCB1Q15051 598 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 ELF2Q15723 593 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 CDC25BP30305 580 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 KCNJ4P48050 445 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 STK3Q13188 491 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPN14Q15678 1187 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 IL17REQ8NFR9 667 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 NEO1Q92859 1461 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 KDRP35968 1356 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 USP16Q9Y5T5 823 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 ERBB3P21860 1342 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC27A2O14975 620 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 SKILP12757 684 aa27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 RICTORQ6R327 1708 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 MAP4K1Q92918 833 aa27.41■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 A0A087WWV3 80 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 USP31Q70CQ4 1352 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 NPHP1O15259 732 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 DDX11Q96FC9 970 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC9A3-201ENST00000264938 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CCZ1BP86790 482 aa27.39■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.39■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 SARM1Q6SZW1 724 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF446Q9NWS9 450 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 JAK2O60674 1132 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ERICH4A6NGS2 130 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC69A6NI79 296 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 BEND3Q5T5X7 828 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ERO1AQ96HE7 468 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ADCY9O60503 1353 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 LRRC37A3O60309 1634 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 PSMA5P28066 241 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 USP6P35125 1406 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 EVI5LQ96CN4 794 aa27.36■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 RPS6KB1P23443 525 aa27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 NEMFO60524 1076 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 ANXA1P04083 346 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 RESTQ13127 1097 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 FLT4P35916 1363 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 A0A0D9SFI3 127 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 SLU7O95391 586 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 AMPHP49418 695 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-201ENST00000264938 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC66A2RUB6 948 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3-201ENST00000264938 CAVIN2O95810 425 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3-201ENST00000264938 LRRN4CLQ8ND94 238 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3-201ENST00000264938 BRF1Q92994 677 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3-201ENST00000264938 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms