RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.87■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.87■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.86■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 SETDB2Q96T68 719 aa21.86■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.86■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 SERPINB2P05120 415 aa21.85■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 BEND3Q5T5X7 828 aa21.85■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 KSR2Q6VAB6 950 aa21.85■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 RGL2O15211 777 aa21.85■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 CEP85Q6P2H3 762 aa21.85■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.84■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.84■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.84■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.84■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 NPHP1O15259 732 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 RGS3P49796 1198 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 TGFB2P61812 414 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 GPR162Q16538 588 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.83■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.83■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 USP44Q9H0E7 712 aa21.82■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 GNAI3P08754 354 aa21.81■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.81■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.81■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 HLFQ16534 295 aa21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 COPS6Q7L5N1 327 aa21.8■■□□□ 1.08
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SRSF1-201ENST00000258962 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 SCN7AQ01118 1682 aa21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 GNAI2P04899 355 aa21.8■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 GCC1Q96CN9 775 aa21.79■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 A0A0G2JLW4 131 aa21.78■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 ALDH1L1O75891 902 aa21.78■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 NUCB1Q02818 461 aa21.77■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 CNBD1Q8NA66 436 aa21.77■■□□□ 1.08
SRSF1-201ENST00000258962 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 PDE4AP27815 886 aa21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 BCORQ6W2J9 1755 aa21.76■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 DPEP1P16444 411 aa21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 ST5P78524 1137 aa21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 LINS1Q8NG48 757 aa21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 DCTPP1Q9H773 170 aa21.75■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 FAM177BA6PVY3 158 aa21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.75■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.74■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 GPTP24298 496 aa21.73■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.73■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.73■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.72■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 PDE6BP35913 854 aa21.72■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.72■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.72■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 MYD88Q99836 296 aa21.72■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 PIM2Q9P1W9 311 aa21.72■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 UTYO14607 1347 aa21.71■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 H0YIN7 160 aa21.71■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 CHRNA5P30532 468 aa21.71■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 ATP8B2P98198 1209 aa21.71■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.71■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 LNPKQ9C0E8 428 aa21.71■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.7■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 PARP10Q53GL7 1025 aa21.7■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.7■■□□□ 1.07
SRSF1-201ENST00000258962 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.7■■□□□ 1.07
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SRSF1-201ENST00000258962 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.7■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 BCS1LQ9Y276 419 aa21.7■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 NUP98P52948 1817 aa21.69■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 KCNA3P22001 575 aa21.69■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.69■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 GRM8O00222 908 aa21.68■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SRSF1-201ENST00000258962 C8orf34Q49A92 452 aa21.67■■□□□ 1.06
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