RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 ZNF428Q96B54 188 aa26.95■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.95■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 ERFEQ4G0M1 354 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 KSR2Q6VAB6 950 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 NYXQ9GZU5 481 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.94■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 MYD88Q99836 296 aa26.93■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 CACNA1SQ13698 1873 aa26.93■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 LAMB2P55268 1798 aa26.92■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 KIF3CO14782 793 aa26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 PDE6BP35913 854 aa26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.9■■□□□ 1.9
COX5B-201ENST00000258424 H0YIN7 160 aa26.88■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SYNE4Q8N205 404 aa26.88■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 IGKV5-2P06315 115 aa26.87■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.87■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 HSPA6P17066 643 aa26.86■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.86■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 F6X3S4 739 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SRGNP10124 158 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 TTLL6Q8N841 843 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 RNF181Q9P0P0 153 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.85■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SLX4Q8IY92 1834 aa26.84■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.84■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.83■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.83■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 FAM89AQ96GI7 184 aa26.83■■□□□ 1.89
COX5B-201ENST00000258424 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 CRY2Q49AN0 593 aa26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.81■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 TOMM70O94826 608 aa26.81■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 STYK1Q6J9G0 422 aa26.81■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 MASTLQ96GX5 879 aa26.81■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 NPR1P16066 1061 aa26.79■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 LINS1Q8NG48 757 aa26.78■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 PTPRCP08575 1304 aa26.78■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 TAF1P21675 1872 aa26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 RASSF7Q02833 373 aa26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 BEND3Q5T5X7 828 aa26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 NLRP3Q96P20 1036 aa26.77■■□□□ 1.88
COX5B-201ENST00000258424 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 CNKSR1Q969H4 720 aa26.76■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 MYH3P11055 1940 aa26.76■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 LMNB1P20700 586 aa26.75■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 GCKRQ14397 625 aa26.75■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.74■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 RRAGCQ9HB90 399 aa26.73■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 COL4A1P02462 1669 aa26.73■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.72■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.72■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 BCAR3O75815 825 aa26.72■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 H7C1W4 665 aa26.71■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.71■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
COX5B-201ENST00000258424 C21orf2O43822 256 aa26.7■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 APLP1P51693 650 aa26.7■■□□□ 1.86
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