RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 NECAB1Q8N987 351 aa18.39■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 KIF4AO95239 1232 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 DAAM2Q86T65 1068 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 CCDC160A6NGH7 325 aa18.38■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 IFNKQ9P0W0 207 aa18.38■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 EVI5LQ96CN4 794 aa18.36■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 TACC1O75410 805 aa18.36■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.35■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 NEBLO76041 1014 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 A6NNZ2 444 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP25P42331 645 aa18.35■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.35■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 NEK1Q96PY6 1258 aa18.34■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 NLRP6P59044 892 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-201ENST00000256413 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.34■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
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CTIF-201ENST00000256413 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 TTC14Q96N46 770 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 PTPRCP08575 1304 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 RTL1A6NKG5 1358 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 ZNF75DP51815 510 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PRG0 241 aa18.31■□□□□ 0.52
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CTIF-201ENST00000256413 CHMP4BP1P59074 171 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 TUBB2AQ13885 445 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 CABP1Q9NZU7 370 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 F6X3S4 739 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 SMARCA4P51532 1647 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 CERS3Q8IU89 383 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 NEK11Q8NG66 645 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 PRAM1Q96QH2 718 aa18.3■□□□□ 0.52
CTIF-201ENST00000256413 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
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