RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 NUCB2P80303 420 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPA4P34932 840 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 USP21Q9UK80 565 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ITGB4P16144 1822 aa22.69■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 RAD50Q92878 1312 aa22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 GLI3P10071 1580 aa22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 MCTP1Q6DN14 999 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 PAPPAQ13219 1627 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 AFF2P51816 1311 aa22.67■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 BARGINQ6ZT62 677 aa22.66■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.66■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 PANK2Q9BZ23 570 aa22.66■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 IL17RAQ96F46 866 aa22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 ATG3Q9NT62 314 aa22.65■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A0G2JS52 829 aa22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 RASEFQ8IZ41 740 aa22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXO41Q8TF61 875 aa22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 GPATCH3Q96I76 525 aa22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.64■■□□□ 1.22
PDLIM4-201ENST00000253754 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 MCM2P49736 904 aa22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 VPS72Q15906 364 aa22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.64■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.63■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 BCL9O00512 1426 aa22.63■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 A1BGP04217 495 aa22.62■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 CUL4AQ13619 759 aa22.62■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF26B4DH59 902 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 PTMSP20962 102 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 PTH1RQ03431 593 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF14Q5TI25 921 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF15Q8N660 670 aa22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.6■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 EVI5LQ96CN4 794 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A087WZG4 1122 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 CPA1P15085 419 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM227BQ96M60 508 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 ERBB4Q15303 1308 aa22.59■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDLIM4-201ENST00000253754 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.57■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 MRE11P49959 708 aa22.56■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM182BQ5T319 152 aa22.56■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.56■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 TTC14Q96N46 770 aa22.56■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 COPRSQ9NQ92 184 aa22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 AK2P54819 239 aa22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 CASP7P55210 303 aa22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 TFCP2Q12800 502 aa22.55■■□□□ 1.2
PDLIM4-201ENST00000253754 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.55■■□□□ 1.2
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