RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 HOXB7P09629 217 aa21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 KRT85P78386 507 aa21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 DDX11Q96FC9 970 aa21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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LRP3-201ENST00000253193 PPFIA3O75145 1194 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.96■■□□□ 1.11
LRP3-201ENST00000253193 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 C3P01024 1663 aa21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 VPS53Q5VIR6 699 aa21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 ME3Q16798 604 aa21.94■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 PDCP20941 246 aa21.94■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.94■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 FAM177BA6PVY3 158 aa21.93■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.93■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.93■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 CCDC192P0DO97 292 aa21.93■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 SPATA32Q96LK8 384 aa21.92■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
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LRP3-201ENST00000253193 GORABQ5T7V8 394 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 FBXW7Q969H0 707 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 A0A0D9SFI3 127 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD1Q15327 319 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 CHRNA2Q15822 529 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 TTC14Q96N46 770 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 PEAK1Q9H792 1746 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 ADCY9O60503 1353 aa21.91■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 A0A087WZG4 1122 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 TNMDQ9H2S6 317 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 SLC27A2O14975 620 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 MTMR6Q9Y217 621 aa21.9■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 SASH1O94885 1247 aa21.89■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 MCM5P33992 734 aa21.89■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.89■■□□□ 1.1
LRP3-201ENST00000253193 ZNF790Q6PG37 636 aa21.89■■□□□ 1.09
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LRP3-201ENST00000253193 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.88■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 MAP3K11Q16584 847 aa21.88■■□□□ 1.09
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LRP3-201ENST00000253193 A0A0G2JS52 829 aa21.87■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 TFCP2Q12800 502 aa21.87■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 TRIM5Q9C035 493 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 DIP2AQ14689 1571 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 UVSSAQ2YD98 709 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 DACT1Q9NYF0 836 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 ATF3P18847 181 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 USP16Q9Y5T5 823 aa21.85■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 KDM4AO75164 1064 aa21.84■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 GCKRQ14397 625 aa21.84■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 NEK1Q96PY6 1258 aa21.84■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 NECTIN1Q15223 517 aa21.84■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 BRF1Q92994 677 aa21.84■■□□□ 1.09
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LRP3-201ENST00000253193 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.83■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 MAP4K1Q92918 833 aa21.83■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LRP3-201ENST00000253193 AKAP12Q02952 1782 aa21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 GOLIM4O00461 696 aa21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 TERF1P54274 439 aa21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 GUCY1B3Q02153 619 aa21.83■■□□□ 1.08
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LRP3-201ENST00000253193 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.83■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.82■■□□□ 1.08
LRP3-201ENST00000253193 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.82■■□□□ 1.08
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