RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 NYXQ9GZU5 481 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 ST5P78524 1137 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP10Q86W26 655 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 RLBP1P12271 317 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 SUSD4Q5VX71 490 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD11-201ENST00000249504 PANK1Q8TE04 598 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 NTSR2O95665 410 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 SYT17Q9BSW7 474 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 BEND3Q5T5X7 828 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV5-2P06315 115 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 LINS1Q8NG48 757 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 ERFEQ4G0M1 354 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC12Q96J65 1359 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH1L1O75891 902 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 TGFB2P61812 414 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 COG6Q9Y2V7 657 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 PDE6BP35913 854 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 FAM89AQ96GI7 184 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.54■■□□□ 1.52
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HOXD11-201ENST00000249504 CRBNQ96SW2 442 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 LAMB2P55268 1798 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JLW4 131 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 H0YIN7 160 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 DPEP1P16444 411 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 CHRNA5P30532 468 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 SYNE4Q8N205 404 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD11-201ENST00000249504 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.52■■□□□ 1.52
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP3Q96P20 1036 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 USP44Q9H0E7 712 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 H7C1W4 665 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 MYH3P11055 1940 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 UTYO14607 1347 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 GRM8O00222 908 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 MEIS3Q99687 375 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 PIM2Q9P1W9 311 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 CACNA1SQ13698 1873 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 SRGNP10124 158 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 KCNA3P22001 575 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
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