RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 IL17RAQ96F46 866 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 ST18O60284 1047 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 TOM1O60784 492 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 ANAPC15P60006 121 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 PIP4K2BP78356 416 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 EVI5LQ96CN4 794 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 TFCP2Q12800 502 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXC11-201ENST00000243082 DDB1Q16531 1140 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 TNNI3KQ59H18 835 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 HSPA4P34932 840 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 RAD50Q92878 1312 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 SLIT2O94813 1529 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 NEK4P51957 841 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 MCM4P33991 863 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 HLFQ16534 295 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 BARGINQ6ZT62 677 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 ATP5JP18859 108 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC11-201ENST00000243082 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ARXQ96QS3 562 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.38■■□□□ 1.17
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HOXC11-201ENST00000243082 GSE1Q14687 1217 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 FAM89AQ96GI7 184 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 EYA2O00167 538 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 MCM2P49736 904 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 PTH1RQ03431 593 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC24Q50LG9 513 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 FAM227BQ96M60 508 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 GPR108Q9NPR9 543 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 NLRP10Q86W26 655 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 SNRKQ9NRH2 765 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 CIAO1O76071 339 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 RASEFQ8IZ41 740 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 FSD1Q9BTV5 496 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 CSF1RP07333 972 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
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HOXC11-201ENST00000243082 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 GPTP24298 496 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 SYNE4Q8N205 404 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 IL27Q8NEV9 243 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC11-201ENST00000243082 A0A0D9SFI3 127 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 HAUS7Q99871 368 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 KCNB2Q92953 911 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 A0A0G2JS52 829 aa22.31■■□□□ 1.16
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