RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.41■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 UTYO14607 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 ELP1O95163 1332 aa26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMA5P28066 241 aa26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 C14orf37Q86TY3 774 aa26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 AP5Z1O43299 807 aa26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 TPM3P06753 285 aa26.39■■□□□ 1.82
HTATSF1-201ENST00000218364 NECAB1Q8N987 351 aa26.39■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SASH1O94885 1247 aa26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC192P0DO97 292 aa26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC27A2O14975 620 aa26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA2P54652 639 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT85P78386 507 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PROSER3Q2NL68 480 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC6Q86TZ1 520 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM227BQ96M60 508 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCP20941 246 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LINS1Q8NG48 757 aa26.37■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KAZALD1Q96I82 304 aa26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD1Q15327 319 aa26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.36■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GRM8O00222 908 aa26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SUCLG2Q96I99 432 aa26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 DTNBO60941 627 aa26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ4P48050 445 aa26.35■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 JCADQ9P266 1359 aa26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MED23Q9ULK4 1368 aa26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF20Q5VTR2 975 aa26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.34■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PXDNQ92626 1479 aa26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.33■■□□□ 1.81
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS6KB1P23443 525 aa26.32■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.32■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K11Q16584 847 aa26.32■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.32■■□□□ 1.8
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HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCB2Q00722 1185 aa26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MRC1P22897 1456 aa26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 LIG1P18858 919 aa26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TYRO3Q06418 890 aa26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 FSD1Q9BTV5 496 aa26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 FERMT3Q86UX7 667 aa26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1-201ENST00000218364 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF3AQ9Y496 699 aa26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 PDIA6Q15084 440 aa26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 IGKV5-2P06315 115 aa26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 PSME1Q06323 249 aa26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA32Q96LK8 384 aa26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TNMDQ9H2S6 317 aa26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1-201ENST00000218364 DACT1Q9NYF0 836 aa26.24■■□□□ 1.79
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