RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	PITPNB	P48739	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LPAR4	Q99677	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		K7EPI3	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SCD	O00767	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HTR3B	O95264	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	F3	P13726	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PSMB4	P28070	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PDK3	Q15120	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RNF39	Q9H2S5	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		H0YIG0	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	JRK	O75564	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GOSR1	O95249	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RAB3A	P20336	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EPHA2	P29317	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	BMX	P51813	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DEFB103A	P81534	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SCARB2	Q14108	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SVBP	Q8N300	66 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		Q9N2J8	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GOSR2	O14653	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ACOX3	O15254	700 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NR2F6	P10588	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PBX1	P40424	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GNPDA1	P46926	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	POU4F3	Q15319	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	AQP9	O43315	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	STBD1	O95210	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RASAL1	O95294	804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINA6	P08185	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NFATC2	Q13469	925 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RSU1	Q15404	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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