RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 MARK4Q96L34 752 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CSF3RQ99062 836 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 WDR41Q9HAD4 459 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RDH8Q9NYR8 311 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 USP22Q9UPT9 525 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SMIM30A4D0T7 59 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 C2orf78A6NCI8 922 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CXorf65A6NEN9 183 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SLC28A1O00337 649 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 UBDO15205 165 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SUPT7LO94864 414 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 IGF2P01344 180 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 MT-ND2P03891 347 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 MELTFP08582 738 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HTR1AP08908 422 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PRSS56P0CW18 603 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 FOSL2P15408 326 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ARSBP15848 533 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 LBPP18428 481 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RAB3BP20337 219 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ID4P47928 161 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CEACAM7Q14002 265 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HNF4GQ14541 408 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 COQ5Q5HYK3 327 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 VWA1Q6PCB0 445 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PDZD3Q86UT5 571 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 AP3S1Q92572 193 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 MED8Q96G25 268 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TAAR9Q96RI9 348 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RNF2Q99496 336 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TEAD3Q99594 435 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 DPH7Q9BTV6 452 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 OPN4Q9UHM6 478 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 YIPF1Q9Y548 306 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 AQP12BA6NM10 295 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 A8MXK9 166 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CBX4O00257 560 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ACOT8O14734 319 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 C1QBP02746 253 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 STAG3L2P0CL84 134 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CNR1P21554 472 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HTR5AP47898 357 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CCL23P55773 120 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PAQR7Q86WK9 346 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RDH10Q8IZV5 341 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 STPG2Q8N412 459 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 STX19Q8N4C7 294 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 GPR137Q96N19 417 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CITED1Q99966 193 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TMED9Q9BVK6 235 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 DYRK4Q9NR20 520 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ADAM20O43506 726 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KLK8O60259 260 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 AK1P00568 194 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C1RP00736 705 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ARSAP15289 507 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CTSSP25774 331 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MS4A2Q01362 244 aa7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms