RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A8P48029 635 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 RFX3P48380 749 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5J2P56134 94 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR5P85299 388 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 BTKQ06187 659 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 LGSNQ5TDP6 509 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF611Q8N823 705 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRG7Q96K78 797 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 STOML1Q9UBI4 398 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM22Q9Y584 194 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CUBNO60494 3623 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC151A5D8V7 595 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GMFGO60234 142 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CRLF1O75462 422 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX30O94993 753 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 UTS2O95399 124 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PYGBP11216 843 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 NID1P14543 1247 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 IMPDH1P20839 514 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 NTSP30990 170 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PKNOX1P55347 436 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CTBP2P56545 445 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf80Q0P641 193 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 LCP2Q13094 533 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TNK1Q13470 666 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 APOOLQ6UXV4 268 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 BEND4Q6ZU67 534 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10D3Q8NH80 312 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ELP4Q96EB1 424 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNA7Q96RP8 456 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FMO2Q99518 471 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10A4Q9H209 315 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MYNNQ9NPC7 610 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCFQ9NPI8 374 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 VDAC3Q9Y277 283 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 COL6A5A8TX70 2615 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WZY1 265 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC36A6NLP5 189 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ALG1L2C9J202 215 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMDEC1O15204 470 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNH1O95259 989 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV1D-16P01601 117 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 IFI6P09912 130 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GABRA3P34903 492 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKAA2P54646 552 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXA1P55317 472 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF844Q08AG5 666 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 LCA5Q86VQ0 697 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 PIK3R3Q92569 461 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC9A6Q92581 669 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-226ENST00000593200 NPAS1Q99742 590 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms