RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLCA1	A8K7I4	914 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989		B4DXG7	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	TM9SF1	O15321	606 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	BIRC5	O15392	142 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	TUBB	P07437	444 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	G6PD	P11413	515 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC1A6	P48664	564 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	GFRA1	P56159	465 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	DLX5	P56178	289 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR5	P85299	388 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	DUSP5	Q16690	384 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NEDD4L-233	ENST00000591989	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989		H3BML4	177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZWINT	O95229	277 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	C6orf47	O95873	294 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	PEPD	P12955	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	HPGD	P15428	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF708	P17019	499 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAPN3	P20807	821 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRPS1L1	P21108	318 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHM	P24386	653 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTSS	P25774	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	LHX2	P50458	406 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASCL1	P50553	236 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	EMX2	Q04743	252 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	STX3	Q13277	289 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	MPP2	Q14168	576 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	MLC1	Q15049	377 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CROCCP2	Q86T23	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	TM9SF2	Q99805	663 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	NTM	Q9P121	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYT5	O00445	386 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEC14L5	O43304	696 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	NDUFB5	O43674	189 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNK2	O95069	426 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	OPRM1	P35372	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	SOAT1	P35610	550 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAP3K8	P41279	467 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	DIO3	P55073	304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLDN18	P56856	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-233	ENST00000591989	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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