RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GJD3	Q8N144	294 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	NT5C	Q8TCD5	201 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RAB8B	Q92930	207 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RGMA	Q96B86	450 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	AHSP	Q9NZD4	102 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PDGFA	P04085	211 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CKM	P06732	381 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	C8A	P07357	584 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GJA1	P17302	382 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ELK1	P19419	428 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	EVI2B	P34910	448 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PGGHG	Q32M88	737 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2L13	Q8N349	312 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.51	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RNF13	O43567	381 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR10H3	O60404	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	FMO6P	O60774	539 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	AHR	P35869	848 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	BCL6	P41182	706 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	SOX9	P48436	509 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CCR8	P51685	355 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GANC	Q8TET4	914 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	IL17F	Q96PD4	163 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	DPH7	Q9BTV6	452 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2AG1	Q9H205	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM170B	A6NMN3	283 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	THBS1	P07996	1170 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PPM1A	P35813	382 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	MNDA	P41218	407 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	AKR1D1	P51857	326 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PRMT2	P55345	433 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR8H3	Q8N146	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RIT1	Q92963	219 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GLTP	Q9NZD2	209 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM127	O75204	238 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	FH	P07954	510 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	UGT2B7	P16662	529 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	TYRP1	P17643	537 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	TEAD2	Q15562	447 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	LNX2	Q8N448	690 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A1W2PS29	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF197	O14709	1029 aa		12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	MYL12B	O14950	172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	EFCAB14	O75071	495 aa		12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	DRD3	P35462	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
KDM4B-208	ENST00000589104	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41

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