RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CMIPQ8IY22 773 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TAGAPQ8N103 731 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NR4A3Q92570 626 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NKD1Q969G9 470 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PNLIPRP2P54317 469 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF836Q6ZNA1 936 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 PACRGLQ8N7B6 248 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF527Q8NB42 609 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35B4Q969S0 331 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TMBIM1Q969X1 311 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 IP6K3Q96PC2 410 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 UBQLN4Q9NRR5 601 aa28.63■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 KCNE5Q9UJ90 142 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX12O00623 359 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EPPINO95925 133 aa28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK14Q16539 360 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH9Q86YJ5 346 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 IL22RA1Q8N6P7 574 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NRBF2Q96F24 287 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB126Q9BYW3 111 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 REEP1Q9H902 201 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OAZ3Q9UMX2 235 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DTNAQ9Y4J8 743 aa28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 ABCB7O75027 752 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HPP00738 406 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF23P17027 643 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 ABCD3P28288 659 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 IL12BP29460 328 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCXD2Q0VAA5 305 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC36Q1X8D7 754 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD2Q8IY47 623 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5K1Q8NHB7 308 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SDCCAG3Q96C92 435 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 CIB1Q99828 191 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL10Q9BXB5 764 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST2Q9Y4C5 530 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CDHR4A6H8M9 788 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HS6ST1O60243 411 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 REM1O75628 298 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OTX2P32243 289 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 FGFBP1Q14512 234 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN2P46Q86SG4 172 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC15A4Q8N697 577 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 H0YJX3 145 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 E2F6O75461 281 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NGFRP08138 427 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPCP11150 499 aa28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R4Q6NUP7 873 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF605Q86T29 641 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIPK1Q86Z02 1210 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CLIP4Q8N3C7 705 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MYOTQ9UBF9 498 aa28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPA7E9PJI5 369 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPA8P0DM63 369 aa28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR6T1Q8NGN1 323 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC14CA4D256 554 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM200CA6NKL6 621 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 G3V2T6 193 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R3H8 397 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DIRAS1O95057 198 aa28.58■■■□□ 2.17
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