RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585630.5

CIRBP-204, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CIRBP, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-204	ENST00000585630	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SLC9A6	Q92581	669 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	UCN2	Q96RP3	112 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	DSN1	Q9H410	356 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	HAO1	Q9UJM8	370 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630		A0A1W2PRB8	838 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CLCA1	A8K7I4	914 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PRIM2	P49643	509 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	KRTAP10-9	P60411	292 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CPTP	Q5TA50	214 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	RAET1L	Q5VY80	246 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	MARCH3	Q86UD3	253 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	NATD1	Q8N6N6	113 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	COX18	Q8N8Q8	333 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	COQ8B	Q96D53	544 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SORT1	Q99523	831 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SPG11	Q96JI7	2443 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ALG1L2	C9J202	215 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	HCRTR2	O43614	444 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	KCNK2	O95069	426 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ANGPTL1	O95841	491 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	IL18BP	O95998	194 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ALOX5	P09917	674 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	G6PD	P11413	515 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	BGN	P21810	368 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CTSS	P25774	331 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	LCN1	P31025	176 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PEX19	P40855	299 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	STAR	P49675	285 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	DIO3	P55073	304 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	EMX2	Q04743	252 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SRY	Q05066	204 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	MYBPH	Q13203	477 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	BCL2A1	Q16548	175 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	APOOL	Q6UXV4	268 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ZAR1	Q86SH2	424 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	GALNT10	Q86SR1	603 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	FAM110B	Q8TC76	370 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SFXN5	Q8TD22	340 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	JADE3	Q92613	823 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	WNT2B	Q93097	391 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	STAC	Q99469	402 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	TM9SF2	Q99805	663 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ZNF559	Q9BR84	538 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	HHATL	Q9HCP6	504 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	MED11	Q9P086	117 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C6orf47	O95873	294 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	HK1	P19367	917 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	TBXA2R	P21731	343 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OPRM1	P35372	400 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	SLC1A6	P48664	564 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	DGKQ	P52824	942 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CLDN8	P56748	225 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	CDC73	Q6P1J9	531 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	ARSK	Q6UWY0	536 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	OR4C3	Q8NH37	302 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	NUDT8	Q8WV74	236 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	LRRC46	Q96FV0	321 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CIRBP-204	ENST00000585630	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		14.92	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms