RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-208	ENST00000560272	MED11	Q9P086	117 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TIMM22	Q9Y584	194 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		A0A087WZY1	265 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		A0A1W2PPR1	153 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR2M5	A3KFT3	312 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	UPK1A	O00322	258 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	RIPK2	O43353	540 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	RGS14	O43566	566 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GMFG	O60234	142 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FADS1	O60427	444 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GLRA3	O75311	464 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	UTS2	O95399	124 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PSMG1	O95456	288 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ANGPTL1	O95841	491 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	IFI6	P09912	130 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRPS2	P11908	318 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	HPGD	P15428	266 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF17	P17021	662 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GABRA3	P34903	492 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GPC1	P35052	558 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CCT5	P48643	541 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CTBP2	P56545	445 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CLDN15	P56746	228 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CLDN20	P56880	219 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRR5	P85299	388 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MARCH3	Q86UD3	253 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CCDC63	Q8NA47	563 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GPR151	Q8TDV0	419 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NUDT8	Q8WV74	236 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FIG4	Q92562	907 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ELP4	Q96EB1	424 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SMR3A	Q99954	134 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	BDH2	Q9BUT1	245 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EQTN	Q9NQ60	294 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NF1	P21359	2839 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	C17orf51	A8MQB3	221 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		B4DXG7	233 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		H0YC42	278 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SLC28A1	O00337	649 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SCD	O00767	359 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PDPK1	O15530	556 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NDUFB5	O43674	189 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SEC22B	O75396	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SYNGR4	O95473	234 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	HSPA4L	O95757	839 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CHEK2	O96017	543 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CGA	P01215	116 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	UROS	P10746	265 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TBXA2R	P21731	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ME2	P23368	584 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GCA	P28676	217 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CCKAR	P32238	428 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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