RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558155.1

SPG11-208, Transcript of SPG11, spatacsin vesicle trafficking associated, human

TSL 5

Gene SPG11, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPG11-208	ENST00000558155	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CDKL2	Q92772	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	OSTF1	Q92882	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155		A0A087WZY1	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155		B4DXG7	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	UBXN8	O00124	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	KCNAB3	O43448	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CXCL13	O43927	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	FADS1	O60427	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	RAMP1	O60894	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	KERA	O60938	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ESRRB	O95718	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TGFA	P01135	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	YES1	P07947	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	EGR1	P18146	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PTN	P21246	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ME2	P23368	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CRABP2	P29373	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	AGTR1	P30556	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	MPI	P34949	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PDLIM4	P50479	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	FABP6	P51161	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	EFNA4	P52798	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CDH11	P55287	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CORO7	P57737	925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	RAB10	P61026	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	RAC1	P63000	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	IRF9	Q00978	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	IFT88	Q13099	833 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	STX5	Q13190	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PPA1	Q15181	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	DECR1	Q16698	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155		Q6ZSR9	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPG11-208	ENST00000558155	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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